85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2203 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  100 
 
 
891 aa  1818    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3071  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  26.57 
 
 
610 aa  150  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39200  hypothetical protein  27.08 
 
 
610 aa  148  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  28.14 
 
 
998 aa  142  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16890  putative auxiliary component of ABC transporter  24.68 
 
 
615 aa  137  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1469  hypothetical protein  24.46 
 
 
614 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  28.34 
 
 
972 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  31.15 
 
 
242 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1563  hypothetical protein  26.7 
 
 
622 aa  124  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.348161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1066  hypothetical protein  24.73 
 
 
600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  28.1 
 
 
964 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 
244 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3142  hypothetical protein  25.95 
 
 
626 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 
242 aa  118  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  32.9 
 
 
256 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  24.24 
 
 
600 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.03 
 
 
247 aa  109  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  32.59 
 
 
244 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  26.52 
 
 
977 aa  104  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  31.2 
 
 
244 aa  104  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1399  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component protein  25.63 
 
 
646 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57373  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  32.91 
 
 
244 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  22.39 
 
 
508 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  36.75 
 
 
243 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  37.8 
 
 
244 aa  103  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  30.64 
 
 
244 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  31.36 
 
 
244 aa  99.4  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  30.64 
 
 
244 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  31.82 
 
 
240 aa  94  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
242 aa  93.6  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  29.73 
 
 
244 aa  93.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  32.39 
 
 
235 aa  91.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 
244 aa  88.2  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1547  gliding motility protein, ABC-related protein  20.75 
 
 
557 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000436101  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2907  hypothetical protein  23.51 
 
 
614 aa  86.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 
234 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4185  hypothetical protein  23.7 
 
 
643 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  30.17 
 
 
241 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.02 
 
 
256 aa  82  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  35.57 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  26.45 
 
 
235 aa  79.7  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26 
 
 
240 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  30.22 
 
 
240 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1945  gliding motility protein GldG  19.85 
 
 
562 aa  72.4  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 
234 aa  72  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  30.67 
 
 
242 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  31.29 
 
 
248 aa  69.7  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  27.71 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3719  gliding motility protein, ABC-related protein  22.1 
 
 
550 aa  64.7  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  32.02 
 
 
270 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 
260 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  26.54 
 
 
770 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  36.43 
 
 
242 aa  62  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 
768 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
261 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2112  hypothetical protein  26.32 
 
 
495 aa  59.7  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
261 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2068  ABC-type transport system protein involved in gliding motility auxiliary component-like protein  26.6 
 
 
729 aa  57.4  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.232799  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  31.33 
 
 
253 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  33.87 
 
 
748 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0779  hypothetical protein  19.57 
 
 
502 aa  55.1  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  30.38 
 
 
239 aa  55.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 
266 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  33.02 
 
 
736 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  30.32 
 
 
250 aa  53.5  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0220  hypothetical protein  21.2 
 
 
561 aa  52.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.447855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0232  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  19.18 
 
 
566 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  32.79 
 
 
251 aa  51.2  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
267 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  26.57 
 
 
462 aa  48.9  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2721  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  19.7 
 
 
561 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.8 
 
 
767 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  32.03 
 
 
918 aa  47.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  46.43 
 
 
270 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  26.13 
 
 
260 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.41 
 
 
244 aa  46.6  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  25.93 
 
 
248 aa  46.2  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  31.85 
 
 
943 aa  45.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  32.19 
 
 
920 aa  45.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  36.73 
 
 
700 aa  44.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4905  gliding-associated putative ABC transporter substrate-binding component GldG  20.77 
 
 
555 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2608  ABC-type uncharacterized transport system  20.83 
 
 
678 aa  44.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00018467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.77 
 
 
914 aa  44.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>