More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2145 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  100 
 
 		 164 aa  343  6e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  39.29 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  39.58 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  39.29 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  41.33 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  41.33 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  41.33 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 		 147 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  35.37 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  30.66 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.85 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.85 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  36.3 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.85 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  36.57 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  31.39 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  38.81 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  35.71 
 
 		 143 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 143 aa  97.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  32.12 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  34.07 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  34.07 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.65 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.39 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 143 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  31.39 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  32.62 
 
 		 148 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  36.73 
 
 		 165 aa  90.5  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  34.35 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  32.65 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  38.24 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  32.14 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  31.16 
 
 		 167 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  27.27 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  36.36 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 		 237 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  38.13 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  38.76 
 
 		 137 aa  84  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  30.56 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1958  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0491085  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  31.58 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  31.58 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  32.06 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  35.66 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.67 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  35.04 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  30.61 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  28.79 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  34.88 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.29 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  37.06 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  36.8 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  36.8 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7202  ferric uptake regulator, Fur family  37.93 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  31.08 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.34 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  34.93 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  31.69 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  28.79 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  30.2 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>