243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2095 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  100 
 
 		 243 aa  502  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 320 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  28.34 
 
 		 393 aa  86.3  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 296 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 285 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 285 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  27.81 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  26.67 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.68 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  24.2 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.32 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  26.06 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  26.06 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  26.09 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.61 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.82 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.47 
 
 		 312 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  25.42 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  26.64 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.07 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  26.05 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.81 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.27 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 		 289 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  29.52 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.65 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26.18 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  27.74 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  40.82 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  23.87 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  24.58 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  26.02 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  23.97 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  25.91 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  24.67 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  35.58 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.71 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  26.4 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.67 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.48 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.33 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  25.94 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.67 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.16 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  24.78 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  24.01 
 
 		 305 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  27.35 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  22.22 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  26.23 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  26.64 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  26.94 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  26.94 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.35 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  26.23 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  26.94 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>