242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2051 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  41.02 
 
 
293 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  40.34 
 
 
291 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  38.8 
 
 
292 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  35.93 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  37.79 
 
 
292 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  37.63 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  38.93 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  36.73 
 
 
291 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  36.73 
 
 
292 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  38.72 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  37.12 
 
 
292 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  38.38 
 
 
292 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  36.05 
 
 
291 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  36.05 
 
 
291 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  35.15 
 
 
291 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  38.98 
 
 
291 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  32.54 
 
 
292 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  36.36 
 
 
294 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  35.47 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  35.25 
 
 
291 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  35.25 
 
 
291 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  35.25 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  35.47 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  35.25 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  33.56 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  34.46 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  34.8 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  34.92 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  34.92 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  34.92 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  36.76 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  35.27 
 
 
289 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  34.34 
 
 
291 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  37.13 
 
 
287 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  37.13 
 
 
287 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  35.33 
 
 
290 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  36.95 
 
 
291 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  36.76 
 
 
287 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  37.13 
 
 
287 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  36.03 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  32.89 
 
 
293 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  34.01 
 
 
293 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  32.2 
 
 
292 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  35.14 
 
 
293 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  36.4 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  32.11 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  31.58 
 
 
294 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  32.57 
 
 
288 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  32.77 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  33.45 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  32.89 
 
 
293 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  34.69 
 
 
309 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  34.9 
 
 
295 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  29.25 
 
 
291 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  32.78 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  33.01 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  32.67 
 
 
292 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  31.6 
 
 
326 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  32.09 
 
 
291 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  34.88 
 
 
287 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  31.77 
 
 
291 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  31.31 
 
 
300 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  34.23 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  33.22 
 
 
295 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  34.33 
 
 
287 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  32.11 
 
 
287 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  30.98 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  34.33 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  31.77 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  32.21 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  31.77 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  32.88 
 
 
287 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  30.64 
 
 
284 aa  135  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  31.53 
 
 
293 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  32.32 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  33.22 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  31.99 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  29.47 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  32.78 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  32.31 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0513  hypothetical protein  28.86 
 
 
296 aa  132  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0201327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  31.99 
 
 
287 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  32.56 
 
 
293 aa  132  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  32.89 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  28.84 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  32.11 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  30.51 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>