More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2025 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  36.52 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 104 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  40.51 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 111 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  37.21 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 91 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 122 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  35.9 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 92 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 101 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  30.85 
 
 		 108 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 91 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 110 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  31.18 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  37.5 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0207  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.239951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0127  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0145  transcriptional repressor PagR, putative  43.42 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0320  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0268  transcriptional repressor PagR  43.42 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 104 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  38.03 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  38.36 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40.58 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 113 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>