155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1996 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  100 
 
 		 306 aa  633  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  37.74 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  40.48 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  40.48 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  38.57 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  37.24 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  34.02 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  33.22 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  33.11 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  34.19 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  35.36 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  38.14 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  33.33 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  32.99 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  36.11 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  38.43 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  32.87 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  168  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  35.1 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  34.3 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  34.14 
 
 		 307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  32.86 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  35.42 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  34.64 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  32.78 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  33.78 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  35.56 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  32.78 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  32.75 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  33.55 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  33.45 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  32.23 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  33.69 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  34.3 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  31.9 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  32.97 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  32.23 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  33.22 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  30.93 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  34.03 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  32.78 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  35.06 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  32.78 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  34.97 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  30.69 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  30.6 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  32.3 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  31.74 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  38.72 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  34.93 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  31.77 
 
 		 286 aa  149  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  31.53 
 
 		 315 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  30.69 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  30.87 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  32.88 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  31.14 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  29.21 
 
 		 304 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  33.07 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  30 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  30 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  32.14 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  31.03 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  29.66 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  29.45 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  26.8 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  31.38 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  31.87 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  35.33 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  32.51 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  32.42 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  31.25 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  32.16 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  29.93 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  31.44 
 
 		 425 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  29.66 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  29.66 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  28.46 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  29.66 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  27.48 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  29.31 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  30.51 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  26.37 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  29.39 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  29.47 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  30.6 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>