298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1942 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  100 
 
 
244 aa  504  1e-142  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  65.35 
 
 
230 aa  311  6e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  64.57 
 
 
223 aa  306  2e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.26628e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  64.57 
 
 
237 aa  305  5e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  61.8 
 
 
241 aa  303  2e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  63.06 
 
 
228 aa  299  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  64.57 
 
 
226 aa  298  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  64.41 
 
 
224 aa  297  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  63.06 
 
 
234 aa  297  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  63.06 
 
 
237 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  62.11 
 
 
226 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  63.96 
 
 
224 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  63.96 
 
 
228 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  62.16 
 
 
228 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  62.95 
 
 
225 aa  295  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  61.09 
 
 
225 aa  293  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  61.09 
 
 
225 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  61.43 
 
 
229 aa  293  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  63.51 
 
 
224 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  62.16 
 
 
224 aa  291  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  63.06 
 
 
224 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  61.4 
 
 
229 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  63.51 
 
 
224 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  61.26 
 
 
226 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  63.06 
 
 
224 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  62.11 
 
 
227 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  61.26 
 
 
221 aa  289  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  62.61 
 
 
224 aa  288  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.03334e-11  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  60.81 
 
 
230 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  56.85 
 
 
244 aa  287  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  62.17 
 
 
224 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  61.71 
 
 
226 aa  284  9e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  63.23 
 
 
232 aa  284  1e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.28539e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  60.36 
 
 
230 aa  283  2e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  61.61 
 
 
223 aa  282  4e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  60.81 
 
 
229 aa  282  4e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  61.06 
 
 
224 aa  280  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  61.71 
 
 
225 aa  279  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  61.26 
 
 
227 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  62.61 
 
 
224 aa  276  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  58.33 
 
 
229 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.53404e-08  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  59.73 
 
 
228 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  57.4 
 
 
230 aa  269  3e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.96721e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  57.4 
 
 
230 aa  269  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  57.01 
 
 
232 aa  268  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  56.64 
 
 
233 aa  268  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  59.11 
 
 
233 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  58.3 
 
 
236 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  59.64 
 
 
234 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  56.09 
 
 
235 aa  265  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  61.26 
 
 
224 aa  264  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  59.65 
 
 
224 aa  264  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  55.27 
 
 
246 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  59.64 
 
 
234 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  59.64 
 
 
234 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  56.31 
 
 
228 aa  261  5e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  55.86 
 
 
227 aa  261  5e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  56.31 
 
 
228 aa  261  8e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  57.52 
 
 
229 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  57.21 
 
 
233 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  57.52 
 
 
229 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  59.73 
 
 
237 aa  252  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  53.81 
 
 
227 aa  238  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  48.78 
 
 
259 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  51.8 
 
 
224 aa  228  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  51.6 
 
 
222 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  48.37 
 
 
285 aa  226  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  49.18 
 
 
256 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  51.34 
 
 
222 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  50.23 
 
 
230 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  52.25 
 
 
227 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.8435e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  48.21 
 
 
229 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  50.44 
 
 
229 aa  216  3e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  50 
 
 
233 aa  215  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.08637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0300  exsB protein  49.05 
 
 
208 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.495784  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  50 
 
 
226 aa  199  4e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  46.79 
 
 
225 aa  199  4e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  46.33 
 
 
225 aa  195  5e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  49.08 
 
 
231 aa  193  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  46.64 
 
 
229 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  45.07 
 
 
224 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  44.55 
 
 
224 aa  183  2e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  45.5 
 
 
224 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  44.44 
 
 
224 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  47.71 
 
 
226 aa  181  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  47.71 
 
 
229 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  42.79 
 
 
225 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  42.79 
 
 
225 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  39.57 
 
 
221 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  37.83 
 
 
221 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  41.98 
 
 
251 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  39.21 
 
 
218 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  41.15 
 
 
258 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  41.78 
 
 
226 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  37.39 
 
 
218 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  39.72 
 
 
484 aa  155  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  42.73 
 
 
226 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  42.29 
 
 
226 aa  155  5e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  41.3 
 
 
221 aa  155  5e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  40.54 
 
 
221 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>