More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1925 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  51.65 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  52.59 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 		 376 aa  242  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 		 279 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  47.57 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  48.45 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  48.45 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  48.28 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  45.83 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  45.53 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  48.11 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 287 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  44.69 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 400 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  47.84 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1386  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0675469  hitchhiker  0.00645369 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  44.35 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 		 345 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.04 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1514  dihydropteroate synthase  47.39 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0169529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  45.67 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  43.54 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  44.77 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  45.74 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  42.34 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  47.89 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 		 397 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  44 
 
 		 435 aa  215  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1716  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 277 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  42.41 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  46.94 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  42.45 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  41.76 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  47.76 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  43.32 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  45.71 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  43.92 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 		 413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  42.55 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 		 278 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0254  dihydropteroate synthase  46.99 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00676186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  44.93 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  44.09 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1911  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 		 393 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  48.28 
 
 		 278 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 272 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 		 275 aa  208  8e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  42.37 
 
 		 436 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  42.12 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  41.22 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  43.6 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>