212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1917 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  100 
 
 		 321 aa  643    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  35.47 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  45.45 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  42.71 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  34.12 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  35.1 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  36.73 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  43.17 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  36.05 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  34.69 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  34.45 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  45.51 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.98 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  38.05 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  31.8 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  37.37 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  42.33 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  37.86 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  33.67 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  34.53 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  35.38 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  34.93 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  36.86 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  40.4 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  33.23 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  32.07 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  35.19 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  31.93 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  33.72 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  30.7 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  30.87 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  30.87 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  30.87 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  31.13 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  35.05 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  32.77 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  32.23 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  35.79 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  35.64 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  39.27 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  38.78 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  37.82 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  32.03 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  34.39 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27.08 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  34.76 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  31.4 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  32.64 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  36.13 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  37.04 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 660 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  38.31 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  36.07 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  34.9 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  33.52 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  28.72 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  30 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  32.32 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  32.28 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  32.07 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  31.38 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  32.29 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  33.16 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  32.2 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  28.23 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  28.95 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  32.96 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>