More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1896 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 138 aa  290  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.38 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  57.81 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  57.14 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  50.75 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  52.31 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  57.94 
 
 		 142 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  48.89 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.49 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  54.76 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  51.13 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.94 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  48.51 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  50.76 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  51.59 
 
 		 140 aa  127  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  53.12 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  48.18 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  52.03 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.93 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  49.63 
 
 		 173 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.44 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  49.62 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  46.97 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  44.6 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  48.89 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  52.21 
 
 		 258 aa  122  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.67 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.03 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.93 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  48.51 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  49.62 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 258 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  48.12 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  45.45 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  45.59 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  45.86 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.66 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  48.48 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.01 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  48.48 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  44.36 
 
 		 138 aa  113  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.14 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  45.8 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.44 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 254 aa  110  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  43.7 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.86 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  46.97 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  44.36 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.93 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.35 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  39.85 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  45.45 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 284 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  47.15 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  46.88 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.34 
 
 		 299 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  43.7 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  42.65 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  45.04 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.03 
 
 		 287 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 257 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  41.27 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.38 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  46.67 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  42.34 
 
 		 299 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 270 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  42.22 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.07 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.84 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 298 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.4 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  43.94 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  38.52 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  39.85 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>