150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1695 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  100 
 
 
534 aa  1120    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  46.5 
 
 
530 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  48.86 
 
 
522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  47.23 
 
 
529 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  45.84 
 
 
530 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  45.89 
 
 
555 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  43.59 
 
 
511 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  42.56 
 
 
528 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  43.16 
 
 
529 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  44.29 
 
 
563 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  46.47 
 
 
529 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.11 
 
 
524 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  43.32 
 
 
549 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  43.38 
 
 
515 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  42.86 
 
 
516 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  45.33 
 
 
531 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  41.87 
 
 
538 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  43.57 
 
 
530 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  41.4 
 
 
535 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  43.36 
 
 
523 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  43.72 
 
 
523 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  41.48 
 
 
521 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  42.39 
 
 
545 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  41.53 
 
 
538 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  41.82 
 
 
521 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  40.51 
 
 
531 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  43.51 
 
 
522 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  41.11 
 
 
528 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  40.45 
 
 
523 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  42.22 
 
 
519 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  41.56 
 
 
494 aa  362  8e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  41.12 
 
 
540 aa  361  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  40.39 
 
 
552 aa  357  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  42.04 
 
 
554 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  39.43 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  41 
 
 
523 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  39.62 
 
 
513 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  40 
 
 
538 aa  347  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  42.66 
 
 
618 aa  343  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  40.11 
 
 
534 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  40.11 
 
 
534 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  42.71 
 
 
502 aa  339  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  40.53 
 
 
558 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  39.01 
 
 
529 aa  329  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  39.63 
 
 
520 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  38.96 
 
 
524 aa  326  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  37.08 
 
 
525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  37.8 
 
 
544 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  39.64 
 
 
529 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  34.54 
 
 
531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.39 
 
 
555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  36.29 
 
 
540 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  35.17 
 
 
541 aa  263  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  36.54 
 
 
587 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  35.62 
 
 
540 aa  259  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  33.88 
 
 
532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  34.18 
 
 
541 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  31.38 
 
 
576 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  32.71 
 
 
617 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  32.71 
 
 
606 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  32.39 
 
 
523 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  31.67 
 
 
583 aa  233  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  34.58 
 
 
574 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  34.18 
 
 
550 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  33.27 
 
 
575 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  31.04 
 
 
596 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  32.37 
 
 
674 aa  219  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.84 
 
 
564 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  30.6 
 
 
589 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  31.6 
 
 
557 aa  210  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  30.4 
 
 
589 aa  210  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 
585 aa  206  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  33.71 
 
 
588 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  30.26 
 
 
641 aa  203  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  29.78 
 
 
557 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  28.79 
 
 
589 aa  203  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  31.77 
 
 
588 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  28.19 
 
 
582 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  31.51 
 
 
588 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  33.14 
 
 
590 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  29.26 
 
 
587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  31.15 
 
 
588 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  31.47 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  31.15 
 
 
588 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  30.81 
 
 
588 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  30.81 
 
 
588 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  29.84 
 
 
600 aa  187  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  34.1 
 
 
588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  34.29 
 
 
589 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  30.14 
 
 
566 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  36.67 
 
 
622 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  27.43 
 
 
714 aa  170  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  32.03 
 
 
587 aa  170  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  28.24 
 
 
710 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  30.16 
 
 
679 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  29.16 
 
 
670 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  46.62 
 
 
209 aa  147  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.78 
 
 
689 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1502  Alkaline phosphatase  26.97 
 
 
545 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  29.5 
 
 
585 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>