More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1689 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
338 aa  687    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.89 
 
 
349 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  56.29 
 
 
343 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.29 
 
 
341 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.29 
 
 
341 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  57.69 
 
 
338 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.83 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.18 
 
 
334 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.66 
 
 
327 aa  354  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  54.81 
 
 
356 aa  352  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  55.16 
 
 
317 aa  352  8e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.21 
 
 
351 aa  348  5e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  52.7 
 
 
317 aa  348  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.69 
 
 
327 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.02 
 
 
356 aa  343  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.29 
 
 
320 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.43 
 
 
308 aa  342  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.15 
 
 
345 aa  341  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  52.45 
 
 
321 aa  338  9e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.44 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  50.47 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.43 
 
 
334 aa  333  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  48.94 
 
 
334 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.85 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 
333 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  47.65 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  47.68 
 
 
324 aa  319  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  49.53 
 
 
343 aa  318  9e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  50.66 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.91 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.97 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.31 
 
 
350 aa  311  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  52.53 
 
 
333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  50.81 
 
 
342 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  49.51 
 
 
324 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  50.33 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.44 
 
 
329 aa  300  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  46.79 
 
 
336 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.34 
 
 
336 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  48.84 
 
 
362 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.5 
 
 
334 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
336 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  48.51 
 
 
324 aa  295  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.88 
 
 
341 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  48.15 
 
 
335 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  48.12 
 
 
346 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  46.98 
 
 
339 aa  292  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  46.67 
 
 
338 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  46.67 
 
 
338 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  47.7 
 
 
338 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47.77 
 
 
328 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  48.72 
 
 
328 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  47.85 
 
 
334 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  49.83 
 
 
332 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  47.81 
 
 
337 aa  288  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.47 
 
 
331 aa  288  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  46.25 
 
 
335 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  48.04 
 
 
332 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  46.25 
 
 
335 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 
333 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  49 
 
 
333 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.04 
 
 
336 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  48.18 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  49.68 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  45.93 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  47.85 
 
 
332 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.15 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  49.17 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  48.52 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  47.68 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  44.48 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  46.42 
 
 
333 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 
313 aa  282  7.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  44.51 
 
 
326 aa  282  8.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.39 
 
 
336 aa  281  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.85 
 
 
336 aa  281  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.94 
 
 
337 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  47.39 
 
 
336 aa  281  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  47.06 
 
 
336 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  46.33 
 
 
337 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  46.95 
 
 
327 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.52 
 
 
310 aa  279  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.34 
 
 
332 aa  279  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  44.81 
 
 
325 aa  279  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  42.2 
 
 
331 aa  278  6e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.58 
 
 
342 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  47.74 
 
 
345 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  45.05 
 
 
315 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  44.24 
 
 
340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  45.11 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.02 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  45.77 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  45.81 
 
 
332 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.66 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  47.34 
 
 
347 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.96 
 
 
354 aa  272  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  44.48 
 
 
339 aa  272  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.74 
 
 
319 aa  271  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.38 
 
 
317 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>