231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1649 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 468 aa  922    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  43.37 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  42.82 
 
 		 449 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  42.32 
 
 		 455 aa  338  9e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  44.52 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  42.48 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  41.79 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  40.55 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  44.14 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  43.39 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  42.13 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  43.36 
 
 		 453 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  42.24 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  47.12 
 
 		 445 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  42.26 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  42.4 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  42.19 
 
 		 451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  43.57 
 
 		 472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.94 
 
 		 391 aa  306  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  40.86 
 
 		 464 aa  306  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.76 
 
 		 396 aa  302  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.3 
 
 		 390 aa  300  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.65 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  40.5 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  40.5 
 
 		 451 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  42.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  40.79 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  39.68 
 
 		 438 aa  292  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.64 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.03 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.31 
 
 		 395 aa  289  7e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 391 aa  289  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.2 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  40.72 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.27 
 
 		 389 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 		 397 aa  286  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  40.85 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  43.21 
 
 		 399 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.53 
 
 		 391 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.99 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.73 
 
 		 391 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  40.91 
 
 		 457 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.73 
 
 		 399 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  41.89 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.91 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.95 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  40.84 
 
 		 452 aa  279  6e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.63 
 
 		 394 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.82 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.4 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.18 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.11 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.11 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.11 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.11 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.11 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.34 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.02 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  37.1 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  41.91 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.59 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.73 
 
 		 389 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  41.92 
 
 		 465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.73 
 
 		 389 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  39.91 
 
 		 391 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  41.29 
 
 		 460 aa  273  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  38.19 
 
 		 382 aa  272  9e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.73 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  38.48 
 
 		 382 aa  272  9e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.95 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  39.39 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.31 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.41 
 
 		 391 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  41.47 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  39.47 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  38.48 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.15 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.18 
 
 		 425 aa  270  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.08 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.65 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  38.75 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.07 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.07 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.07 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  43.07 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  37.79 
 
 		 427 aa  266  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.07 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.07 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.07 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.07 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  38.26 
 
 		 470 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  41.26 
 
 		 402 aa  266  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.27 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.32 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>