More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1583 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  45.32 
 
 
1455 aa  911    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  43.09 
 
 
1034 aa  813    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 
1045 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  41.84 
 
 
1034 aa  768    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  46.74 
 
 
1053 aa  919    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  47.22 
 
 
1048 aa  891    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  35.36 
 
 
1052 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  40.64 
 
 
1021 aa  737    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  42.94 
 
 
1032 aa  788    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  43.06 
 
 
1033 aa  828    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  36.64 
 
 
1033 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  34.81 
 
 
1066 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  36.03 
 
 
1032 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  41.94 
 
 
1016 aa  739    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  41.45 
 
 
1049 aa  727    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  36.31 
 
 
1038 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  44.12 
 
 
1064 aa  877    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  44.96 
 
 
1038 aa  867    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  40.45 
 
 
1066 aa  802    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  34.4 
 
 
1039 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  40.36 
 
 
1075 aa  771    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  47.31 
 
 
1053 aa  919    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  45.31 
 
 
1077 aa  904    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  46.37 
 
 
1049 aa  906    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  46.37 
 
 
1052 aa  888    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  47.41 
 
 
1054 aa  919    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  43.28 
 
 
1036 aa  760    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  38.68 
 
 
1033 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  38.51 
 
 
1029 aa  701    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  42.37 
 
 
1032 aa  788    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  46.21 
 
 
1038 aa  864    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  42.66 
 
 
1032 aa  790    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  40.96 
 
 
1028 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  37.23 
 
 
1039 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  41.74 
 
 
1038 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  47.73 
 
 
1075 aa  927    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  38.94 
 
 
1037 aa  690    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  41.29 
 
 
1023 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  47.93 
 
 
1059 aa  937    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  40.34 
 
 
1070 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  45.13 
 
 
1066 aa  847    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  35.8 
 
 
1050 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  45.59 
 
 
1077 aa  910    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  42.8 
 
 
1045 aa  778    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  47.18 
 
 
1047 aa  919    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  46.93 
 
 
1062 aa  917    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  34.86 
 
 
1056 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  46.79 
 
 
1050 aa  910    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  38.53 
 
 
1017 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  45.88 
 
 
1070 aa  919    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  33.69 
 
 
1045 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  42.32 
 
 
1034 aa  796    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  39.59 
 
 
1028 aa  734    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  40.26 
 
 
1065 aa  810    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  39.41 
 
 
1064 aa  794    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  42.83 
 
 
1037 aa  822    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  37.49 
 
 
1021 aa  718    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  39.52 
 
 
1040 aa  742    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  39.86 
 
 
1019 aa  739    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  45.27 
 
 
1058 aa  853    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  45.74 
 
 
1077 aa  906    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  44.49 
 
 
1022 aa  784    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3857  heavy metal efflux pump CzcA  41.86 
 
 
1045 aa  732    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  36.79 
 
 
1040 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  42.23 
 
 
1026 aa  717    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  42.12 
 
 
1083 aa  813    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  38.43 
 
 
1017 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  45.4 
 
 
1043 aa  904    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  44.36 
 
 
1038 aa  887    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  42.94 
 
 
1031 aa  813    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.17 
 
 
1029 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  46.03 
 
 
1040 aa  928    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  46.35 
 
 
1046 aa  891    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  37.42 
 
 
1017 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  45.6 
 
 
1083 aa  912    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  39.33 
 
 
1077 aa  761    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  45.82 
 
 
1070 aa  884    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  44.93 
 
 
1070 aa  877    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  46.72 
 
 
1056 aa  873    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  41.55 
 
 
1026 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  40.24 
 
 
1070 aa  773    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  46.41 
 
 
1069 aa  920    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  45.34 
 
 
1072 aa  886    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  42.8 
 
 
1079 aa  847    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  36.66 
 
 
1050 aa  671    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  46.89 
 
 
1063 aa  931    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  40.9 
 
 
1076 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  41.05 
 
 
1076 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  42.87 
 
 
1023 aa  793    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  46.1 
 
 
1043 aa  919    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.3 
 
 
1481 aa  825    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  36.89 
 
 
1045 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  40.08 
 
 
1062 aa  775    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  36.26 
 
 
1027 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  41.38 
 
 
1075 aa  786    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  41.77 
 
 
1078 aa  795    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  40.89 
 
 
1081 aa  794    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.820402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  45.79 
 
 
1070 aa  917    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  44.43 
 
 
1037 aa  870    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  45.24 
 
 
1456 aa  886    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>