More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1565 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  100 
 
 
453 aa  944    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  43.45 
 
 
620 aa  358  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  40.52 
 
 
485 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  30.82 
 
 
537 aa  200  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  29.69 
 
 
564 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  30.97 
 
 
559 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  28.43 
 
 
520 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  29.71 
 
 
483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  29.04 
 
 
526 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  26.69 
 
 
523 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  28.66 
 
 
511 aa  167  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  28.28 
 
 
511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  28.72 
 
 
474 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  27.25 
 
 
522 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  30.79 
 
 
478 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30.15 
 
 
535 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  27.34 
 
 
515 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  28.98 
 
 
506 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  28.72 
 
 
517 aa  149  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  28.98 
 
 
494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  29.23 
 
 
537 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  25.3 
 
 
549 aa  143  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.07 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  28.02 
 
 
505 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  27.8 
 
 
465 aa  139  7.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  28.77 
 
 
536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  27.75 
 
 
493 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.6 
 
 
482 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  27.52 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  28.7 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3110  sulfatase  29.36 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  24.05 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  26.26 
 
 
631 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  25.91 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  26.51 
 
 
554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  27.93 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  27.74 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  28.21 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  27.46 
 
 
481 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  27.73 
 
 
442 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  25.27 
 
 
526 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  27.62 
 
 
474 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  27.3 
 
 
489 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  26.79 
 
 
453 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  27.27 
 
 
498 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  25.97 
 
 
482 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  25.85 
 
 
554 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  27.91 
 
 
509 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  26.94 
 
 
572 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  27.98 
 
 
520 aa  124  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  25.62 
 
 
481 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  24.55 
 
 
467 aa  123  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  26.48 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  25.45 
 
 
614 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  25.48 
 
 
470 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.45 
 
 
471 aa  120  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1519  sulfatase  25.93 
 
 
537 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0408631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  26.1 
 
 
492 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  26.51 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  26.67 
 
 
516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  25.65 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.87 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  24.52 
 
 
511 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  27.52 
 
 
511 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  27.76 
 
 
512 aa  116  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  28.17 
 
 
490 aa  116  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  26.71 
 
 
516 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.48 
 
 
565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  27.43 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  27.62 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  25.65 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  26.71 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  27.37 
 
 
508 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  26.71 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  25.81 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  28.47 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  25.68 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  26.13 
 
 
474 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.79 
 
 
440 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  25.27 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  25.62 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2114  sulfatase  27.8 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.711307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  26.55 
 
 
489 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  25.33 
 
 
482 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  26.3 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25 
 
 
508 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  26.53 
 
 
466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  30.99 
 
 
545 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  25.15 
 
 
471 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  25.59 
 
 
496 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  25 
 
 
514 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  25.95 
 
 
512 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  26.67 
 
 
496 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  24.46 
 
 
476 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0054  sulfatase  27.79 
 
 
461 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  26.98 
 
 
477 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  24.79 
 
 
499 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0627  sulfatase  25.36 
 
 
474 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  24.53 
 
 
510 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.12 
 
 
497 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>