55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1523 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  100 
 
 
423 aa  863    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  34.25 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  41.81 
 
 
503 aa  123  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  33.81 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  32.9 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  32.9 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  33.81 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  32.23 
 
 
369 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  40 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  34.69 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  31.69 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  34.38 
 
 
315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  32.95 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  32.91 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  31.11 
 
 
550 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  39.18 
 
 
493 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  37.02 
 
 
499 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  32.99 
 
 
378 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  32.97 
 
 
317 aa  106  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  30.4 
 
 
392 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  27.48 
 
 
350 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  37.08 
 
 
491 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  35.35 
 
 
397 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  32.93 
 
 
493 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  37.43 
 
 
491 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  36.11 
 
 
326 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  32.3 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  30.74 
 
 
342 aa  96.3  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  33 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  34.33 
 
 
492 aa  94  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  33.02 
 
 
378 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  32.67 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  28.39 
 
 
341 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  27.8 
 
 
330 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  33.33 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  32.88 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  30.04 
 
 
493 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  28.87 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  34.13 
 
 
501 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  34.13 
 
 
501 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  28.74 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  32.73 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  28.16 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  28.57 
 
 
504 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  23.77 
 
 
684 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  37.89 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  27.08 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  35.11 
 
 
337 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  24.87 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  25 
 
 
373 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  28.75 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  34.92 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  22.22 
 
 
834 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  27.04 
 
 
365 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  28.75 
 
 
365 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>