204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1441 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
598 aa  1233    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  52.17 
 
 
570 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  44.89 
 
 
550 aa  545  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  47.71 
 
 
594 aa  535  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  48.44 
 
 
559 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  45.33 
 
 
553 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  39 
 
 
580 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  35.17 
 
 
545 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.48 
 
 
544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  41.27 
 
 
333 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  35.65 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  40.06 
 
 
339 aa  238  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  40.84 
 
 
339 aa  237  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.67 
 
 
558 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  39.05 
 
 
339 aa  229  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.47 
 
 
339 aa  229  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.53 
 
 
341 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  39.72 
 
 
325 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.88 
 
 
338 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  39.37 
 
 
325 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  39.09 
 
 
326 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  38.78 
 
 
325 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.2 
 
 
343 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  39.16 
 
 
325 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.5 
 
 
339 aa  214  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.86 
 
 
350 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  37.72 
 
 
344 aa  210  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.15 
 
 
342 aa  208  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.34 
 
 
343 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  38.21 
 
 
342 aa  207  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  35.12 
 
 
343 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  35.42 
 
 
343 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  35.33 
 
 
343 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  37.39 
 
 
343 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  34.42 
 
 
346 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.01 
 
 
343 aa  204  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  37.16 
 
 
344 aa  203  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  36.5 
 
 
343 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  38.44 
 
 
343 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.93 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  35.69 
 
 
346 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.56 
 
 
333 aa  201  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.91 
 
 
344 aa  200  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  33.93 
 
 
343 aa  198  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.8 
 
 
342 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.1 
 
 
344 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.8 
 
 
344 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  34.74 
 
 
344 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.39 
 
 
343 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  36.83 
 
 
343 aa  194  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  36.26 
 
 
346 aa  194  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  36.61 
 
 
344 aa  193  8e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  33.13 
 
 
334 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.94 
 
 
343 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.8 
 
 
334 aa  181  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.49 
 
 
731 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.16 
 
 
330 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  33.24 
 
 
731 aa  178  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  32.6 
 
 
727 aa  173  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.38 
 
 
350 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.64 
 
 
332 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  32.11 
 
 
331 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.93 
 
 
347 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  30.75 
 
 
336 aa  164  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.33 
 
 
344 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  32.54 
 
 
336 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.82 
 
 
332 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.02 
 
 
347 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.12 
 
 
331 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 
330 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.38 
 
 
330 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  28.9 
 
 
331 aa  150  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  34.11 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  30.23 
 
 
333 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.66 
 
 
331 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  28.43 
 
 
333 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  30.93 
 
 
323 aa  144  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  30.14 
 
 
331 aa  143  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  36.2 
 
 
333 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  28 
 
 
331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
333 aa  141  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  26.78 
 
 
326 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  26.62 
 
 
331 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  27.67 
 
 
330 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.08 
 
 
330 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  29.41 
 
 
360 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  33.9 
 
 
371 aa  137  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.74 
 
 
330 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  28.67 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.72 
 
 
319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.06 
 
 
330 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  30.23 
 
 
337 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.15 
 
 
337 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  27.67 
 
 
330 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.27 
 
 
327 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  30.14 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  25.98 
 
 
330 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.49 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  30.56 
 
 
691 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.16 
 
 
329 aa  127  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>