More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1419 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
345 aa  710    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.69 
 
 
349 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.6 
 
 
351 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  53.44 
 
 
317 aa  364  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  52.5 
 
 
317 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.78 
 
 
320 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.38 
 
 
334 aa  359  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.16 
 
 
356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  52.65 
 
 
343 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.31 
 
 
341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  54.87 
 
 
356 aa  349  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  52.62 
 
 
321 aa  348  6e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.17 
 
 
320 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.34 
 
 
341 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  52.01 
 
 
338 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.85 
 
 
334 aa  344  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.17 
 
 
327 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.58 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.92 
 
 
327 aa  342  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.15 
 
 
379 aa  342  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.15 
 
 
338 aa  341  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
333 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  47.27 
 
 
334 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  49.68 
 
 
334 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  48.09 
 
 
324 aa  305  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  44.87 
 
 
324 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.06 
 
 
325 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  48.37 
 
 
329 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  45.48 
 
 
343 aa  300  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  44.79 
 
 
324 aa  296  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  46.93 
 
 
349 aa  295  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  46.41 
 
 
336 aa  295  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  46.65 
 
 
335 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  45.86 
 
 
330 aa  294  1e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  45.73 
 
 
318 aa  293  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.42 
 
 
341 aa  291  9e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.47 
 
 
333 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  43.5 
 
 
328 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.25 
 
 
325 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  48.44 
 
 
324 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  48.04 
 
 
335 aa  288  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  45.24 
 
 
335 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  44.94 
 
 
335 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  46.57 
 
 
342 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.79 
 
 
310 aa  287  2e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.34 
 
 
336 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  47.71 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.74 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  45.13 
 
 
346 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  47.74 
 
 
335 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  46.06 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.34 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  47.42 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  48.37 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  48.04 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.4 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.23 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.69 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  45.9 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.04 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  43.73 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  47.73 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.18 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  47.08 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.68 
 
 
313 aa  282  6.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  46.27 
 
 
334 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  42.33 
 
 
325 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.78 
 
 
350 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  41.69 
 
 
339 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  46.39 
 
 
333 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  46.75 
 
 
337 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.06 
 
 
328 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  44.01 
 
 
315 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  46.67 
 
 
346 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  46.54 
 
 
332 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.39 
 
 
336 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  43.67 
 
 
327 aa  279  4e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  47.39 
 
 
337 aa  278  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  47.39 
 
 
334 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  44.44 
 
 
339 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.69 
 
 
337 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  44.14 
 
 
333 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  43.52 
 
 
326 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.51 
 
 
333 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 
344 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 
356 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  47.39 
 
 
332 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.92 
 
 
331 aa  276  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  46.01 
 
 
332 aa  275  6e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.73 
 
 
334 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.51 
 
 
354 aa  275  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  44.71 
 
 
362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 
329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  46.93 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  45.71 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  46.96 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  47.63 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  46.89 
 
 
334 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  46.23 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  44.44 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>