74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1399 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 163 aa  327  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  35 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  32.32 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  29.34 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  28.92 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.2 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  29.05 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  30.17 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  30.5 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  31.52 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.88 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  28.31 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  26.19 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.65 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.17 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.46 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  23.49 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  25.6 
 
 		 174 aa  50.8  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.19 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  30.38 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.54 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  37.1 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.06 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  32.21 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  31.51 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  25.74 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  25.57 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.56 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.71 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.97 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  22.97 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  25.15 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  25.15 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  33.33 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  31.47 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  26.24 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  24.11 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.59 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.27 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  24 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  32.59 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  22.3 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.28 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  22.98 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.26 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  26.9 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  29.53 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  28.66 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  22.86 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  28.66 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  25.6 
 
 		 163 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  29.27 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.7 
 
 		 158 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.53 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  29.27 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  29.27 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  29.27 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  29.27 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  27.88 
 
 		 160 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  28.22 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  29.2 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.67 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.37 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  29.27 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  29.27 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  28.66 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>