More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1395 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  100 
 
 		 478 aa  989    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  58.91 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  59.74 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  59.96 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  59.17 
 
 		 474 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  59.08 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  58.64 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  58.64 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  59.52 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  58.42 
 
 		 478 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  58.42 
 
 		 478 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  58.42 
 
 		 485 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  56.25 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  54.74 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  55.46 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  57.84 
 
 		 471 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  54.11 
 
 		 475 aa  518  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  55.84 
 
 		 485 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  56.24 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  56.14 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  56.11 
 
 		 480 aa  521  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  55.07 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  57.24 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  55.07 
 
 		 475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  56.07 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  57.4 
 
 		 471 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  52.84 
 
 		 463 aa  510  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 482 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  56.89 
 
 		 474 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  53.06 
 
 		 485 aa  502  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  53.51 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  54.2 
 
 		 483 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  55.08 
 
 		 483 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 467 aa  498  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  52.74 
 
 		 485 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  57.73 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  52.4 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  53.51 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  52.4 
 
 		 477 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  52.8 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  52.4 
 
 		 477 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  53.04 
 
 		 521 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  53.91 
 
 		 560 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  53.41 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  53.28 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  52.4 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  52.4 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  53.29 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  52.18 
 
 		 477 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  56.24 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  53.28 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  52.4 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  52.4 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  53.51 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  53.48 
 
 		 571 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  52.18 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  51.49 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  51.7 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  51.97 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  52.76 
 
 		 480 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  53.2 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  51.7 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  53.51 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  52.18 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  54.92 
 
 		 475 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  53.39 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  55.68 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  51.49 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  54.01 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  53.54 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  55.48 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  53.39 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  52.98 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  53.38 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  52.85 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  55.58 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 		 476 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  54.37 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  52.98 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  54 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  52.85 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 		 479 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  55.25 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  52.76 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  54.65 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000107475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  53.06 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  53.7 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  50.77 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  52.43 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  54.44 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  52.1 
 
 		 472 aa  465  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  51.77 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 		 476 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>