294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1392 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.57 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  41.82 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  38.57 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  42.27 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  39.29 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  38.84 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  35.62 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  38.39 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  35.59 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  32.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  32 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  36.28 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  38.84 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  35.94 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  33.93 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  34.07 
 
 		 231 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  35 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  34.51 
 
 		 217 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  33.93 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  34.96 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  37.9 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  37.17 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  33.19 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  31.39 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  33.63 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  32.74 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  32.74 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  32.14 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  36.16 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  32.29 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  33.79 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  34.91 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  30.94 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  33.16 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  33.49 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  33.04 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  31.56 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  31.42 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0807  TrkA-N domain protein  32.29 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  29.53 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  34.21 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  34.21 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  35.24 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  33.92 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  33.92 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  36.31 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  30.91 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  31.36 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  34.96 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  34.36 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  34.36 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1606  K+ uptake transporter, KtrA subunit  29.13 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000611134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  34.36 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  30.67 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  33.63 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  29.86 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  31.84 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3603  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  33.9 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  38.07 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  30.22 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  32.78 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  31.92 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  36.93 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  34.46 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  35.59 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0294  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  31.42 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  33.71 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  32.13 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  31.22 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>