More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1370 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 		 291 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 290 aa  311  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 289 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  48.78 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 292 aa  288  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  47.04 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 290 aa  285  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 290 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 293 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 290 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 292 aa  278  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  49.33 
 
 		 297 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 291 aa  272  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 294 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  48.92 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  48.92 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  47.2 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 294 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  47.28 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  45.27 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  45.27 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  47.84 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  45.27 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  45.27 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  48.2 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  45.27 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  45.27 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  45.27 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  48.2 
 
 		 301 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  47.84 
 
 		 300 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  47.84 
 
 		 300 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  43.96 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  46.28 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  45.76 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 		 292 aa  255  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  44.26 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  48.43 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 298 aa  252  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 291 aa  248  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 		 297 aa  248  8e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 296 aa  246  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>