More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1365 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  46.92 
 
 
330 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.31 
 
 
254 aa  222  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.74 
 
 
470 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  45.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  45.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  45.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  45.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  41.92 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  45.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  45.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  45.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  45.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  45.17 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  40.67 
 
 
258 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.79 
 
 
253 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  41.92 
 
 
255 aa  217  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.79 
 
 
253 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.08 
 
 
284 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  41.22 
 
 
257 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  41.22 
 
 
257 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.21 
 
 
392 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.35 
 
 
253 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  43.68 
 
 
253 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.06 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.94 
 
 
462 aa  215  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 
303 aa  214  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.23 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.64 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.51 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.85 
 
 
317 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.36 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  43.85 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.76 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.46 
 
 
437 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  42.69 
 
 
294 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.46 
 
 
265 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  43.61 
 
 
260 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.75 
 
 
250 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.85 
 
 
433 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  39.46 
 
 
265 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  42.91 
 
 
361 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.28 
 
 
282 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  43.08 
 
 
254 aa  209  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.7 
 
 
273 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  41.7 
 
 
273 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  43.08 
 
 
308 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.27 
 
 
339 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  45.25 
 
 
253 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.91 
 
 
284 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.75 
 
 
264 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  41.15 
 
 
251 aa  208  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.44 
 
 
282 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  41.44 
 
 
270 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.15 
 
 
257 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  44.44 
 
 
260 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  41.04 
 
 
265 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  41.04 
 
 
265 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
260 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.75 
 
 
264 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  42.11 
 
 
268 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  39.77 
 
 
283 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.15 
 
 
286 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.46 
 
 
346 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.61 
 
 
270 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  41.42 
 
 
268 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  40.89 
 
 
261 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.42 
 
 
289 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  40.89 
 
 
265 aa  205  5e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.02 
 
 
253 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.54 
 
 
315 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.38 
 
 
301 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  38.7 
 
 
265 aa  205  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  41.15 
 
 
264 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.7 
 
 
265 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.15 
 
 
255 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.15 
 
 
294 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  42.48 
 
 
293 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.77 
 
 
257 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.93 
 
 
265 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  40.38 
 
 
264 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  43.08 
 
 
259 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.01 
 
 
261 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  40.77 
 
 
370 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  43.85 
 
 
335 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  39.69 
 
 
249 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.15 
 
 
273 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  43.85 
 
 
333 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  43.85 
 
 
335 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.21 
 
 
273 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  38.49 
 
 
253 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  42.37 
 
 
341 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.23 
 
 
262 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  42.15 
 
 
254 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.96 
 
 
410 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.77 
 
 
284 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.63 
 
 
253 aa  202  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.02 
 
 
252 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  41.09 
 
 
348 aa  201  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  42.15 
 
 
262 aa  201  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>