More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1341 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
465 aa  955    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.58 
 
 
540 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.38 
 
 
543 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  41.72 
 
 
469 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.7 
 
 
541 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.28 
 
 
536 aa  345  8.999999999999999e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.33 
 
 
530 aa  342  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.98 
 
 
474 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  40.73 
 
 
465 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 
525 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 
535 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  41.2 
 
 
470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  40.18 
 
 
467 aa  336  5e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  39.86 
 
 
467 aa  335  9e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 
468 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.26 
 
 
471 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  40.86 
 
 
468 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  40.34 
 
 
469 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  37.42 
 
 
570 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  40.22 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.38 
 
 
481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 
489 aa  325  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 
522 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  40.48 
 
 
478 aa  323  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.87 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.61 
 
 
480 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 
464 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.61 
 
 
480 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.51 
 
 
470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.61 
 
 
480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  41.39 
 
 
484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.06 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 
460 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  41.9 
 
 
460 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 
468 aa  317  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  43.08 
 
 
467 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.96 
 
 
460 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
461 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  36.66 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.17 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  39.18 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.18 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  38.68 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 
462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  38.46 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  38.31 
 
 
462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 
515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  40.86 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 
465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  41.43 
 
 
478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 
462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.72 
 
 
466 aa  312  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.24 
 
 
525 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 
477 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 
478 aa  308  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  38.83 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.84 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 
454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.57 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 
454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 
465 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 
466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.55 
 
 
455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  35.78 
 
 
535 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.13 
 
 
490 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  38.31 
 
 
524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  37.82 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  37.5 
 
 
452 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.83 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 
544 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.81 
 
 
465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  37.26 
 
 
452 aa  303  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  38.37 
 
 
452 aa  303  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
464 aa  302  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 
531 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 
547 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 
462 aa  301  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
536 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  40.71 
 
 
455 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  37.47 
 
 
454 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  37.47 
 
 
454 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 
455 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  39.1 
 
 
467 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 
452 aa  299  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 
465 aa  299  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.53 
 
 
453 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
454 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
470 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  36.78 
 
 
476 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 
455 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
525 aa  296  8e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  36.47 
 
 
461 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 
468 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 
467 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  37.84 
 
 
453 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 
536 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  37.84 
 
 
455 aa  294  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  36.64 
 
 
465 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>