More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1339 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1339  iojap-like protein  100 
 
 
144 aa  297  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  36.67 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  40.2 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  38.61 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  39.81 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  40.78 
 
 
142 aa  87  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  47.37 
 
 
118 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  40 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  43.01 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0131  Iojap-related protein  42.86 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.468906  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  38.24 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  37.5 
 
 
191 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  43.01 
 
 
198 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  43.01 
 
 
198 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  41.18 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  39.25 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  37.17 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  37.38 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  38.74 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  41.05 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  40 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  38.61 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0789  Iojap-related protein  36.04 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  36.7 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  42.2 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  41.94 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  39.22 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  37.19 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  34.95 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  40.38 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  41.24 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  37.89 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  36.45 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  38.95 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  36.45 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  38.68 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  40.59 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  35.78 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  37.62 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  41.49 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  41.11 
 
 
117 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  36.73 
 
 
118 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  34.29 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  33.64 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2225  iojap-like protein  41.75 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.194852  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  34.31 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  36.27 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  31.82 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  34.86 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  35.79 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  31.78 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  37.04 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1149  iojap-like protein  40.4 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  41.94 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  41.05 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4228  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4556  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  34.86 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1847  iojap-like protein  34.23 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0198054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  36.96 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000680321  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  40 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4411  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0836383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4066  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.08408e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4076  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000293892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4463  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4450  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  36.96 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000071595  hitchhiker  0.00000138621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  36.11 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  40.22 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  32.29 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  35.04 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  38.46 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  38.95 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  35.11 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  32.26 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0345  iojap-like protein  36.36 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  34.34 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  37.23 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  39.78 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  39.08 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  39.08 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  35.11 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  40 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  37.78 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  37.63 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  36.17 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  38.3 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  38.3 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  38.3 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  38.3 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  36.17 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0801  iojap-like protein  38.64 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000037946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0778  iojap-like protein  38.64 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000818526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  34.65 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  34.65 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0719  hypothetical protein  36.28 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00101649  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  39.13 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  36.84 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  34.65 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>