178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1319 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  100 
 
 
331 aa  685    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  61.74 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  59.51 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  59.2 
 
 
343 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  57.64 
 
 
624 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  59.74 
 
 
318 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  54.8 
 
 
343 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  52.98 
 
 
624 aa  338  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  48.21 
 
 
601 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  50 
 
 
613 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  46.73 
 
 
608 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  51.27 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  50.18 
 
 
425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  48.24 
 
 
620 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  47.32 
 
 
412 aa  295  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  47.23 
 
 
422 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  46.05 
 
 
483 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  46.36 
 
 
418 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  46.69 
 
 
305 aa  265  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  46.69 
 
 
305 aa  265  7e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  45.42 
 
 
434 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  45.49 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  45.78 
 
 
456 aa  261  8.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  42.9 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  41.12 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  43.79 
 
 
645 aa  241  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  39.61 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  38.83 
 
 
311 aa  238  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  40.2 
 
 
310 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  39.87 
 
 
310 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  39.87 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  39.54 
 
 
310 aa  235  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  39.54 
 
 
310 aa  235  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  39.87 
 
 
310 aa  235  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  39.87 
 
 
310 aa  235  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  39.87 
 
 
310 aa  235  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  39.87 
 
 
310 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  39.41 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  39.41 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  39.41 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  40.83 
 
 
307 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  39.49 
 
 
315 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  43.1 
 
 
317 aa  228  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  40.14 
 
 
307 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  39.87 
 
 
331 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  40.56 
 
 
308 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  39.55 
 
 
309 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  41.49 
 
 
347 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  39.72 
 
 
307 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  42.01 
 
 
333 aa  223  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  39.09 
 
 
309 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  38.91 
 
 
309 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  39.59 
 
 
309 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  39.22 
 
 
308 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  39.59 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  39.59 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  39.59 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  39.59 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  39.59 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  39.93 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  36.04 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  36.04 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  36.04 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  36.04 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  36.04 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  36.04 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  36.04 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  36.84 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  36.04 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  41.02 
 
 
304 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  41.02 
 
 
304 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  39.74 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  39.25 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  39.25 
 
 
309 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  39.25 
 
 
309 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  40.68 
 
 
304 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  41.02 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  40.68 
 
 
304 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  40.96 
 
 
304 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  39.25 
 
 
309 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  39.93 
 
 
311 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  41.02 
 
 
333 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  39.58 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  41.52 
 
 
309 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  38.39 
 
 
306 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  39.02 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  39.93 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  38.89 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  38.39 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  40.07 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  42.29 
 
 
304 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  40.61 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  40.61 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  40.34 
 
 
304 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  41.37 
 
 
304 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  40.35 
 
 
309 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  40.61 
 
 
304 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  40.61 
 
 
304 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  40.61 
 
 
304 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  39.07 
 
 
309 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>