63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1292 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  604  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  38.3 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  34.73 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  32.49 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  23.99 
 
 		 680 aa  72.4  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  27.57 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.63 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  26.35 
 
 		 326 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  23.85 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.22 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  22.88 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  28.19 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  25.32 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  21.01 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  28.68 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  22.58 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  24.05 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  20.91 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  26.74 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000711091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 342 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 380 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>