57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1285 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  61.01 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  62.11 
 
 		 175 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  60.38 
 
 		 170 aa  204  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  60.38 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  61.01 
 
 		 169 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  59.75 
 
 		 170 aa  200  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  60.38 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  59.75 
 
 		 170 aa  200  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  59.12 
 
 		 160 aa  200  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  61.64 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  59.12 
 
 		 171 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  59.12 
 
 		 171 aa  198  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  61.64 
 
 		 169 aa  197  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  59.63 
 
 		 170 aa  197  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  58.49 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  57.14 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  59.01 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  55.56 
 
 		 396 aa  183  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  61.01 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  58.02 
 
 		 392 aa  175  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  57.41 
 
 		 392 aa  167  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  50.92 
 
 		 403 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  51.23 
 
 		 393 aa  164  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  50 
 
 		 393 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  54.94 
 
 		 393 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  49.4 
 
 		 178 aa  150  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  50.62 
 
 		 393 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  47.62 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  43.98 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  43.71 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  42.77 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  42.77 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  42.77 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  45.24 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  40.96 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  42.94 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  41.42 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  43.79 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  40.36 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  40.36 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  40.96 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  37.72 
 
 		 182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  35 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  34.76 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  34.76 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  34.76 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  34.15 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  38.65 
 
 		 211 aa  104  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  33.12 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  32.93 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  32.72 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  33.95 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  33.95 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  33.95 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.65 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  43.24 
 
 		 119 aa  62  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>