More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1213 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  100 
 
 
487 aa  1011    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  45.47 
 
 
479 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  45.88 
 
 
470 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  43.01 
 
 
472 aa  360  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  42.26 
 
 
471 aa  352  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  39.75 
 
 
467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  35.64 
 
 
539 aa  309  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  37.14 
 
 
500 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  39.04 
 
 
457 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  35.4 
 
 
558 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  39.63 
 
 
440 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  36.76 
 
 
543 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  40.49 
 
 
491 aa  266  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  35.2 
 
 
553 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  38 
 
 
495 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  33.88 
 
 
559 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  37.03 
 
 
465 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  36.93 
 
 
471 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  37.93 
 
 
482 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  36.85 
 
 
462 aa  256  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  36.42 
 
 
457 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  32.91 
 
 
551 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  37.53 
 
 
442 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  36.14 
 
 
452 aa  247  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  37.12 
 
 
491 aa  246  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  35.4 
 
 
470 aa  246  9e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  35.1 
 
 
486 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  32.88 
 
 
517 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  34.5 
 
 
548 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  35.03 
 
 
453 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  34.47 
 
 
438 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  34.62 
 
 
442 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  34.04 
 
 
453 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  35.32 
 
 
506 aa  221  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  35.46 
 
 
459 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  32.42 
 
 
523 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  32.46 
 
 
497 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  30.19 
 
 
533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.85 
 
 
490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  31.95 
 
 
510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  34.34 
 
 
464 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  33.56 
 
 
457 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  33.05 
 
 
488 aa  211  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  32.82 
 
 
483 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  32.74 
 
 
474 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  32.33 
 
 
492 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  31.96 
 
 
536 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  31.07 
 
 
542 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  31.61 
 
 
468 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.92 
 
 
486 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  34.72 
 
 
631 aa  203  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.77 
 
 
466 aa  202  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  32.39 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  32.68 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  33.96 
 
 
480 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  33.48 
 
 
478 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  31.02 
 
 
563 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.87 
 
 
462 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42934  arylsulfatase  34.11 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  29.12 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  30.44 
 
 
553 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  28.92 
 
 
539 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  35.14 
 
 
458 aa  197  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  28.92 
 
 
560 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  28.92 
 
 
560 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  28.92 
 
 
560 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  28.92 
 
 
560 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  29.45 
 
 
581 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  32.44 
 
 
460 aa  196  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  31.64 
 
 
584 aa  196  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.85 
 
 
480 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  32.75 
 
 
484 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  32.06 
 
 
481 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  31.13 
 
 
519 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.5 
 
 
500 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  29.8 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  31.41 
 
 
571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  27.33 
 
 
534 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1378  sulfatase  27.33 
 
 
557 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3148  sulfatase  27.35 
 
 
534 aa  190  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  30.19 
 
 
772 aa  189  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  31.76 
 
 
501 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  31.22 
 
 
637 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  31.75 
 
 
453 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.39 
 
 
497 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  29.2 
 
 
543 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  26.43 
 
 
535 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  26.43 
 
 
535 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  26.43 
 
 
535 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  31.47 
 
 
578 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.16 
 
 
482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  30.46 
 
 
609 aa  183  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  31.48 
 
 
493 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  31.4 
 
 
497 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  31.4 
 
 
497 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  30.82 
 
 
489 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  31.4 
 
 
497 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  31.4 
 
 
497 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  29.31 
 
 
627 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  30.39 
 
 
638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>