More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1188 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 322 aa  654    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  38.15 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  36.16 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  34.31 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  33.67 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  33.67 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.67 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.67 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  33.67 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  33.68 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  34.77 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  34.35 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 297 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  34.77 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  32.88 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 		 423 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  32.25 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  30.48 
 
 		 380 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  29.79 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  30.61 
 
 		 389 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 388 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  31.21 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  29.02 
 
 		 401 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  30.96 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  32.25 
 
 		 387 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  32.89 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  33.09 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  31.11 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  27.47 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  32.73 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  30.18 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  30.82 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  29.33 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  31.52 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  27.47 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 389 aa  122  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  30.33 
 
 		 418 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.35 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  30.43 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  29.49 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.61 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  30.58 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  30.07 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  27.33 
 
 		 382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  31.58 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  26.4 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  31.39 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  30.9 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  29.45 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  31.14 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  27.33 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.19 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  30.56 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>