More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1159 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 		 341 aa  708    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  51.7 
 
 		 348 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  50.17 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  49.22 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  48.65 
 
 		 323 aa  295  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  47.32 
 
 		 325 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  47.32 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  50 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  47.26 
 
 		 328 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  46.69 
 
 		 320 aa  292  7e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  45.67 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  47.13 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  46.77 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.33 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  47.8 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.72 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.8 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  47.14 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  46.18 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.95 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  44.9 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.39 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  45.4 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.28 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  45.71 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  43.95 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  47.62 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  44.41 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  44.76 
 
 		 304 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  48.65 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.85 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.66 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.98 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  44.3 
 
 		 315 aa  269  5.9999999999999995e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.76 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  44.9 
 
 		 324 aa  255  7e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  43.49 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  42.04 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  42.26 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  40.49 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  42.36 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.54 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  42.86 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1554  quinolinate synthetase  45.05 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  41.72 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.91 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0768  quinolinate synthetase  40.55 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.68917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0852  quinolinate synthetase  42.91 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00075405  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  43.62 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  39.69 
 
 		 345 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  40.96 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1789  quinolinate synthetase  42.12 
 
 		 355 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  41.46 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  40.81 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1740  quinolinate synthetase  41.08 
 
 		 352 aa  225  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2737  quinolinate synthetase  42.72 
 
 		 384 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.919283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  42.62 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0476  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.12 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00468623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  41.14 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.33 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2717  quinolinate synthetase  42.07 
 
 		 382 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  40.82 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1712  quinolinate synthetase  41.3 
 
 		 355 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0567053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.39 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2327  quinolinate synthetase  41.75 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0615138 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  41.28 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1476  quinolinate synthetase  40.89 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.646287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  40.07 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0702  quinolinate synthetase  40.89 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000554253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.06 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  40.23 
 
 		 334 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2281  quinolinate synthetase  39.75 
 
 		 355 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.880932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1103  quinolinate synthetase  41.03 
 
 		 375 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.16 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  42.67 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2243  quinolinate synthetase  38.29 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1938  quinolinate synthetase  41.52 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  41.25 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1231  quinolinate synthetase  39.94 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  40.88 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1260  quinolinate synthetase  39.94 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720292  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2553  quinolinate synthetase  42.58 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  39.56 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4187  quinolinate synthetase  39.94 
 
 		 352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  41.47 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2424  quinolinate synthetase  42.58 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274031  hitchhiker  0.000442231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1282  quinolinate synthetase  40.68 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  39.44 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0852  quinolinate synthetase  40.83 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000151704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0777  quinolinate synthetase  40.83 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.46 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  39.69 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00703  quinolinate synthetase  40.83 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000418206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2892  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.83 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2912  quinolinate synthetase  40.83 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00694281  normal  0.200335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.64 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0773  quinolinate synthetase  40.83 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000227851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00692  hypothetical protein  40.83 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0102  quinolinate synthetase  38.56 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.535189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3981  quinolinate synthetase  39.61 
 
 		 352 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>