More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1110 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  100 
 
 
599 aa  1216  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  41.43 
 
 
563 aa  445  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  40.65 
 
 
561 aa  439  1e-122  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.36 
 
 
561 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  38.56 
 
 
561 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.98772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  36.94 
 
 
560 aa  401  1e-110  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  36.4 
 
 
560 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.81 
 
 
559 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.53 
 
 
559 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.87 
 
 
558 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  37.21 
 
 
557 aa  365  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.5 
 
 
561 aa  363  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  34.71 
 
 
565 aa  363  5e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.86884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  37.7 
 
 
558 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.59 
 
 
568 aa  358  1e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  36.82 
 
 
581 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  36.47 
 
 
581 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  38.6 
 
 
552 aa  350  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.9 
 
 
559 aa  350  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.9 
 
 
559 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.38 
 
 
554 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  33.99 
 
 
558 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  35.68 
 
 
582 aa  342  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.41 
 
 
592 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.55 
 
 
552 aa  340  6e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.3 
 
 
584 aa  337  3e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  35.2 
 
 
562 aa  333  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.16 
 
 
558 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  34.67 
 
 
582 aa  332  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  36.41 
 
 
582 aa  331  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.89 
 
 
557 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.99 
 
 
559 aa  330  5e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  31.32 
 
 
564 aa  330  6e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  32.01 
 
 
558 aa  329  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.81 
 
 
558 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.74003e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  36.12 
 
 
557 aa  327  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.76 
 
 
556 aa  321  2e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  37.55 
 
 
556 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  34.35 
 
 
549 aa  314  2e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  34.77 
 
 
571 aa  314  3e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  33.39 
 
 
559 aa  313  4e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.19 
 
 
549 aa  313  8e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.72 
 
 
558 aa  311  3e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.09 
 
 
557 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  35.34 
 
 
557 aa  309  1e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.94 
 
 
573 aa  307  4e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.24 
 
 
543 aa  306  1e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  34.44 
 
 
544 aa  304  4e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  30.85 
 
 
560 aa  303  4e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  34.24 
 
 
543 aa  303  5e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  34.76 
 
 
557 aa  303  6e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  35.02 
 
 
544 aa  303  6e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  34.24 
 
 
556 aa  303  6e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  34.11 
 
 
559 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  34.06 
 
 
555 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.62 
 
 
555 aa  299  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  33.62 
 
 
591 aa  293  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.24 
 
 
547 aa  292  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  33.13 
 
 
584 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  31.45 
 
 
547 aa  289  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  35.06 
 
 
560 aa  289  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  33.13 
 
 
561 aa  288  3e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  35.01 
 
 
563 aa  286  6e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  34.4 
 
 
560 aa  283  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  34.33 
 
 
585 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  34.68 
 
 
544 aa  281  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.4 
 
 
537 aa  280  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  35.15 
 
 
582 aa  279  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  9.24249e-08  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.79 
 
 
561 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  34.49 
 
 
545 aa  277  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  33.99 
 
 
578 aa  276  1e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34 
 
 
565 aa  275  1e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34 
 
 
565 aa  275  1e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.7 
 
 
530 aa  275  2e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  33.65 
 
 
558 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  31 
 
 
537 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  31.01 
 
 
551 aa  269  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  33.19 
 
 
571 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  34.87 
 
 
556 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.58 
 
 
506 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.61 
 
 
504 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  32.49 
 
 
560 aa  260  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  30.64 
 
 
586 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.91 
 
 
546 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  34.09 
 
 
559 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.4 
 
 
509 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  33.18 
 
 
550 aa  255  1e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.98 
 
 
551 aa  256  1e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  29.71 
 
 
555 aa  254  2e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  34.51 
 
 
567 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  35.37 
 
 
572 aa  253  9e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  28.37 
 
 
549 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  30.89 
 
 
606 aa  252  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  30.84 
 
 
555 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  35.11 
 
 
572 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  30.54 
 
 
555 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.32 
 
 
501 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  34.99 
 
 
550 aa  250  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  32.43 
 
 
566 aa  251  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.6 
 
 
547 aa  250  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>