151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1080 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  100 
 
 		 1136 aa  2329    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  28.08 
 
 		 659 aa  125  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  26.53 
 
 		 769 aa  97.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.53 
 
 		 759 aa  96.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.53 
 
 		 759 aa  95.5  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.53 
 
 		 759 aa  95.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  26.53 
 
 		 759 aa  94.7  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  26.53 
 
 		 759 aa  94.7  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  26.53 
 
 		 759 aa  94  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.24 
 
 		 759 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.84 
 
 		 759 aa  94  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.99 
 
 		 759 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.9 
 
 		 769 aa  93.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  25.18 
 
 		 619 aa  88.6  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.27 
 
 		 629 aa  87.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  24.87 
 
 		 593 aa  77.4  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  26.04 
 
 		 632 aa  77.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.56 
 
 		 635 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  23.31 
 
 		 952 aa  77  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  25.33 
 
 		 466 aa  77.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  24.21 
 
 		 901 aa  75.1  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.17 
 
 		 611 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  23.54 
 
 		 1584 aa  73.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.22 
 
 		 1189 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  25.29 
 
 		 625 aa  72  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  23.31 
 
 		 613 aa  72  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  25.06 
 
 		 588 aa  72  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  28.03 
 
 		 1280 aa  72  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  24.83 
 
 		 986 aa  71.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.75 
 
 		 632 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  27.51 
 
 		 601 aa  69.7  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1350 aa  69.3  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  27.23 
 
 		 615 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.19 
 
 		 651 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.87 
 
 		 934 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1126 aa  66.6  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.84 
 
 		 636 aa  67.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.27 
 
 		 585 aa  67  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.06 
 
 		 609 aa  67.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  22.79 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  23.91 
 
 		 388 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.48 
 
 		 902 aa  65.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  26.76 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  21.73 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.78 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1118 aa  65.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25.66 
 
 		 1153 aa  65.1  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  27.92 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  26.76 
 
 		 622 aa  65.1  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1116 aa  65.1  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  26.67 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  24.01 
 
 		 610 aa  64.3  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.64 
 
 		 754 aa  64.3  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  26.11 
 
 		 716 aa  63.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.23 
 
 		 606 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  21.35 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 		 1203 aa  62.4  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.41 
 
 		 1090 aa  61.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  26.12 
 
 		 464 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.54 
 
 		 612 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  24.62 
 
 		 619 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  26.42 
 
 		 1228 aa  59.3  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  24.81 
 
 		 1041 aa  58.9  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  22.53 
 
 		 1048 aa  58.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  23.19 
 
 		 925 aa  58.2  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  20.4 
 
 		 1111 aa  58.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.46 
 
 		 795 aa  57.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  22.91 
 
 		 616 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1215 aa  58.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  25.18 
 
 		 673 aa  57.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  23.6 
 
 		 1999 aa  57  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 706 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25.86 
 
 		 902 aa  56.2  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  21.52 
 
 		 633 aa  56.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0350  DNA helicase II related protein, putative  22.7 
 
 		 394 aa  55.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00193946  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  27.69 
 
 		 268 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  24.57 
 
 		 1335 aa  55.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  21.99 
 
 		 975 aa  54.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  25.44 
 
 		 1185 aa  54.3  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  27.86 
 
 		 941 aa  54.3  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  21.96 
 
 		 633 aa  54.3  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  24.31 
 
 		 579 aa  54.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  21.55 
 
 		 827 aa  53.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  24.03 
 
 		 1056 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  24.21 
 
 		 712 aa  53.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  22.65 
 
 		 819 aa  53.5  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  22.09 
 
 		 695 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  28.77 
 
 		 1403 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.98 
 
 		 1077 aa  52.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25 
 
 		 1585 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  25.62 
 
 		 1198 aa  52.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  23.23 
 
 		 922 aa  52.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25 
 
 		 1585 aa  52.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  25.45 
 
 		 1163 aa  52  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.76 
 
 		 479 aa  52  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  24.52 
 
 		 758 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25.18 
 
 		 486 aa  51.6  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  27.4 
 
 		 553 aa  51.6  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>