197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1024 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 278 aa  545  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.88 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  34.65 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  30.45 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.62 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  33.71 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  32.33 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.74 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  32.33 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  32.33 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.46 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  33.83 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  44.7 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.24 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  32.34 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.96 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  30.22 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.97 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.85 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.06 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.69 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.06 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.06 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.14 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.06 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.06 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  32.21 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  31.35 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  45.38 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.73 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  31.68 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.68 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  31.68 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.68 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  45.69 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  45.69 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.46 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  45.69 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  45.69 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  45.69 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  45.69 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  45.69 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  44.83 
 
 		 252 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.96 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.89 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  33.45 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.04 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.96 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  31.48 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  31.15 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.7 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.32 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.86 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.74 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  31.6 
 
 		 224 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  41.3 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  40 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.44 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.66 
 
 		 257 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.47 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.82 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.47 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  32.34 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  40.17 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.21 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.35 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.77 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  28.35 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  28.57 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  28.35 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.76 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.16 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  30.83 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.97 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.44 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.66 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  42.02 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  44.07 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  43.22 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  43.22 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  43.22 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.93 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.6 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.07 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.23 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  38.26 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.85 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.64 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.45 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.46 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.53 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.22 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.49 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.81 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.78 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  39.13 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.87 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>