143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1017 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  100 
 
 		 123 aa  248  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  34.21 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  41.59 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  35.96 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  34.86 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  32.48 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  31.67 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  32.48 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  26.61 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  32.5 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  37.7 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  26.72 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  47.37 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  36.97 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  36.67 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  32.48 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  30.97 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  26.09 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  26.09 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  25.93 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  30.25 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  48.57 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  44.74 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  50 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  31.62 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  44.74 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  35.78 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  25.22 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  35.34 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  28.44 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  25.22 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  25.44 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  30.25 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  44.16 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  25.89 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  44.16 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  36.21 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  47.14 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  43.75 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  32.77 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  28.21 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  35.48 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  45.68 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  42.68 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  44.44 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  24.17 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  28.18 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  38.57 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0317  CopY family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  hitchhiker  0.0079489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  47.06 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  24.78 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  23.73 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  43.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  20.17 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>