More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0936 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  100 
 
 		 479 aa  990    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  45.47 
 
 		 487 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  42.01 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  40.81 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  40.13 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  36.23 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  35.56 
 
 		 539 aa  300  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  34.68 
 
 		 500 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  36.51 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  33.68 
 
 		 559 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  35.82 
 
 		 553 aa  260  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  37.72 
 
 		 491 aa  256  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  34.46 
 
 		 551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  37.07 
 
 		 495 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  36.53 
 
 		 482 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  34.71 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  35.71 
 
 		 465 aa  247  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  36.42 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  34.43 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  34.65 
 
 		 471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  35.47 
 
 		 486 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  35.96 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  34.86 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  33.12 
 
 		 543 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  32.1 
 
 		 517 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  33.33 
 
 		 548 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  33.13 
 
 		 536 aa  229  6e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  33.19 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  36.95 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  35.56 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.62 
 
 		 486 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  34.83 
 
 		 457 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  34.62 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  32.68 
 
 		 558 aa  225  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  32.61 
 
 		 468 aa  223  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.91 
 
 		 470 aa  222  9e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  34.02 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  34.09 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  33.03 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.08 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  32.44 
 
 		 523 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  32.69 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  34.22 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42934  arylsulfatase  33.4 
 
 		 564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.49 
 
 		 462 aa  210  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  31.81 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  32.15 
 
 		 488 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  31.53 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.91 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  31.33 
 
 		 543 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.67 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  34.8 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  32.35 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  30.59 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  31.77 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  33.96 
 
 		 459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  31.67 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  31.96 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  31.9 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  33.48 
 
 		 489 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  31.47 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.34 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.4 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  30.27 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  31.51 
 
 		 484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.4 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  31.15 
 
 		 627 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  31.11 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  30.06 
 
 		 533 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  30.2 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  31.84 
 
 		 631 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.28 
 
 		 497 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.14 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  32.03 
 
 		 637 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  30.47 
 
 		 638 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  30.63 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  27.48 
 
 		 535 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  31.47 
 
 		 551 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  27.48 
 
 		 535 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  33.26 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  27.48 
 
 		 535 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  31.7 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  32.05 
 
 		 500 aa  190  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  30.51 
 
 		 474 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  30.74 
 
 		 513 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  31.46 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  28.99 
 
 		 563 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.65 
 
 		 497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  29.69 
 
 		 542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  28.86 
 
 		 766 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  29.89 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  27.86 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  31.69 
 
 		 542 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  28.52 
 
 		 555 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  27.97 
 
 		 560 aa  179  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  28.49 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  28.49 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  28.49 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  28.49 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  30.38 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>