More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0928 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.66 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.14 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.93 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  34.65 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 240 aa  99  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 209 aa  98.2  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 256 aa  98.2  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  33.53 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  32.93 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  31.74 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 591 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 411 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 155 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.31 
 
 		 442 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 391 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  27.7 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  31.02 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  27.7 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 440 aa  88.2  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 224 aa  87.8  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.23 
 
 		 442 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.35 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  35.14 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.12 
 
 		 443 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.35 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.35 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 445 aa  85.5  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.57 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 402 aa  85.1  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 447 aa  85.1  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.47 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.04 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 452 aa  82.4  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>