268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0862 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  100 
 
 		 574 aa  1181    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  36.36 
 
 		 674 aa  170  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30.68 
 
 		 407 aa  151  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  36.64 
 
 		 330 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  32.58 
 
 		 944 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.77 
 
 		 598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  34.04 
 
 		 323 aa  140  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.31 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  30.77 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.98 
 
 		 334 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  35.74 
 
 		 623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  33.8 
 
 		 1103 aa  126  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.2 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  34.84 
 
 		 503 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  32.67 
 
 		 579 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  27.54 
 
 		 341 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.31 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.85 
 
 		 301 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.42 
 
 		 318 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.92 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.29 
 
 		 319 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  31.62 
 
 		 546 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  25.82 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  27.62 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  27.62 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  31.05 
 
 		 322 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  25.83 
 
 		 353 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  27.62 
 
 		 384 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.81 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  31.22 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.97 
 
 		 528 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.31 
 
 		 531 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  27.62 
 
 		 393 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  27.21 
 
 		 346 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  26.99 
 
 		 346 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  26.37 
 
 		 346 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  28.67 
 
 		 341 aa  90.9  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  28.71 
 
 		 347 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  25.64 
 
 		 352 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  29.96 
 
 		 539 aa  88.6  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.36 
 
 		 529 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.06 
 
 		 391 aa  87.8  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  28.63 
 
 		 550 aa  87  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  27.37 
 
 		 323 aa  87  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  32.07 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  32.24 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  27.8 
 
 		 552 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  26.27 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  29.02 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  28.63 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  32.92 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.76 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  26.9 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.97 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  30 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.74 
 
 		 551 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  29.74 
 
 		 764 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  28.37 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.58 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  31.25 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  24.74 
 
 		 591 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  27.23 
 
 		 476 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  26.21 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.28 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  29.8 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  27.44 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  35.03 
 
 		 625 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  27.38 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  27.44 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  35.71 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  27.44 
 
 		 540 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  27.78 
 
 		 555 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  28.8 
 
 		 551 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  26.61 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  27.47 
 
 		 540 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  31.48 
 
 		 775 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  30.96 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  31.53 
 
 		 466 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  24.05 
 
 		 545 aa  72  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  28.57 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  27.98 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  25.88 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  26.61 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  30.94 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  28.57 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  26.61 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30.69 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  31.11 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  24.66 
 
 		 568 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  30.16 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  31.13 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  31.13 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  31.13 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  31.13 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  31.46 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  31.13 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  23.15 
 
 		 319 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  31.13 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  28.49 
 
 		 550 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  30.24 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>