33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0782 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1031    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  33.75 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  32.91 
 
 		 242 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  33.75 
 
 		 242 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  33.06 
 
 		 237 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  33.75 
 
 		 242 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.28 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  32.28 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  33.12 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  33.12 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  32.28 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  32.28 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  32.28 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  32.28 
 
 		 242 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  32.26 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  32.28 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  31.29 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.06 
 
 		 218 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.07 
 
 		 424 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  33.61 
 
 		 242 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  34.45 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  31.93 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  33.33 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.66 
 
 		 262 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  33.33 
 
 		 256 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.37 
 
 		 315 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  31.09 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  51.22 
 
 		 241 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.85 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  25.65 
 
 		 236 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  28.43 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  38.71 
 
 		 426 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  27.84 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>