64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0739 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
277 aa  552  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  27.72 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  28.09 
 
 
262 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  28.09 
 
 
262 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  28.21 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  29 
 
 
261 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  29.85 
 
 
259 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  29.96 
 
 
260 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  28.36 
 
 
264 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  27.24 
 
 
264 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  25.75 
 
 
261 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  27.24 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  27.61 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  25.32 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  29.41 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  29.15 
 
 
262 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  29.15 
 
 
262 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  27.37 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  26.77 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  28.36 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  27.74 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  28.09 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  27.51 
 
 
262 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  27.04 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  27.61 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  29.37 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  28.09 
 
 
262 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  28.09 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  26.55 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  28.46 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  23.51 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  26.5 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  25.71 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  22.86 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  24.55 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  22.42 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  23.66 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  22.42 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  21.97 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  21.97 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  21.97 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  21.97 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  21.97 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  21.97 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  27.31 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  21.4 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  26.88 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  21.21 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  23.1 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  21.43 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  22.38 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  25.87 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  25.87 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  20.6 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  25.85 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  24.46 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  20.18 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  27.57 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  22.17 
 
 
260 aa  45.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  23.87 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  23.78 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  23.96 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>