110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0730 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 828 aa  1662    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  29.79 
 
 		 488 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  27.94 
 
 		 436 aa  154  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  28.96 
 
 		 458 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  30.33 
 
 		 424 aa  147  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  29.2 
 
 		 424 aa  145  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  30.06 
 
 		 452 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  23.85 
 
 		 447 aa  117  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  25.58 
 
 		 423 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1662  hypothetical protein  25.84 
 
 		 493 aa  97.8  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  23.89 
 
 		 407 aa  90.9  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  24.47 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  22.1 
 
 		 446 aa  67.4  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  24.05 
 
 		 481 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  21.74 
 
 		 489 aa  67.4  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  24.37 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1624  protein of unknown function DUF107  28.87 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  25.14 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  22.84 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  23.5 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  23.04 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  24.07 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  23.04 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0326  protein of unknown function DUF107  29.28 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0124428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  23.83 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  28.46 
 
 		 283 aa  56.2  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2489  hypothetical protein  45 
 
 		 171 aa  55.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  23.56 
 
 		 447 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  22.71 
 
 		 454 aa  54.3  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  30.83 
 
 		 421 aa  53.9  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  29.61 
 
 		 158 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  23.08 
 
 		 235 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  23.08 
 
 		 235 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  42.86 
 
 		 283 aa  52.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  52  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  25.07 
 
 		 460 aa  52  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  22.5 
 
 		 488 aa  51.6  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  21.14 
 
 		 449 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  21.56 
 
 		 472 aa  51.6  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  41.27 
 
 		 272 aa  51.6  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0392  protein of unknown function DUF107  27.88 
 
 		 170 aa  51.6  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  24.01 
 
 		 498 aa  51.2  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  41.27 
 
 		 274 aa  51.2  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  41.27 
 
 		 274 aa  51.2  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  41.27 
 
 		 274 aa  51.2  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  41.54 
 
 		 301 aa  50.8  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  23.44 
 
 		 463 aa  50.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  31.25 
 
 		 394 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  21.37 
 
 		 508 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  29.08 
 
 		 433 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  21.11 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  22.4 
 
 		 437 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  23.2 
 
 		 464 aa  50.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  25.13 
 
 		 612 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  22.84 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  29.53 
 
 		 439 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  22.41 
 
 		 438 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 430 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  28.97 
 
 		 446 aa  48.9  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  25 
 
 		 522 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  27.78 
 
 		 552 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.68 
 
 		 371 aa  48.9  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  23.08 
 
 		 462 aa  48.5  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.81 
 
 		 323 aa  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0857  hypothetical protein  43.4 
 
 		 163 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  23.26 
 
 		 443 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  21.65 
 
 		 465 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  26.47 
 
 		 452 aa  47.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  24.79 
 
 		 318 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  24.79 
 
 		 318 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  19.88 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  29.37 
 
 		 286 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  32.19 
 
 		 302 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  20.1 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0830  hypothetical protein  27.34 
 
 		 410 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  27.15 
 
 		 388 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  28.87 
 
 		 423 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.77 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  32.58 
 
 		 292 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  22.74 
 
 		 524 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  24.8 
 
 		 286 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  22.51 
 
 		 464 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  22.57 
 
 		 458 aa  45.8  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  22.29 
 
 		 458 aa  46.2  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0308  hypothetical protein  31.96 
 
 		 386 aa  46.2  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.89 
 
 		 324 aa  45.8  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  34.92 
 
 		 280 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  24.41 
 
 		 286 aa  45.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  35.38 
 
 		 278 aa  45.8  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  27.5 
 
 		 470 aa  45.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  21.11 
 
 		 557 aa  45.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  22.49 
 
 		 473 aa  45.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  33.77 
 
 		 276 aa  45.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  20.95 
 
 		 462 aa  45.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  26.83 
 
 		 270 aa  45.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  24.16 
 
 		 488 aa  45.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  34.92 
 
 		 280 aa  45.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.23 
 
 		 270 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>