More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0604 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
536 aa  1085  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
347 aa  236  1e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.07 
 
 
343 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.07 
 
 
343 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
346 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
360 aa  223  5e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.33 
 
 
368 aa  223  5e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.94 
 
 
379 aa  221  2e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
356 aa  214  3e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.99 
 
 
350 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.28 
 
 
350 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
343 aa  203  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
343 aa  197  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.81 
 
 
365 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
353 aa  184  4e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.38 
 
 
352 aa  183  9e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.82 
 
 
344 aa  182  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.07 
 
 
346 aa  180  5e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.81 
 
 
352 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.36904e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.42 
 
 
352 aa  177  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.7 
 
 
351 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.1 
 
 
352 aa  170  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.9 
 
 
353 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.86 
 
 
351 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2019  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.81 
 
 
352 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
207 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  40.38 
 
 
478 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.38 
 
 
208 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.47 
 
 
206 aa  137  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
217 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.22 
 
 
206 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.05 
 
 
219 aa  135  1e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.62 
 
 
219 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.88 
 
 
207 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.82 
 
 
223 aa  132  1e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  41.34 
 
 
212 aa  132  1e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
219 aa  132  2e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.13 
 
 
219 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45 
 
 
203 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.62 
 
 
219 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.62 
 
 
219 aa  130  7e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
206 aa  130  7e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
224 aa  130  8e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.11 
 
 
218 aa  130  9e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
225 aa  129  1e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.32 
 
 
212 aa  129  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.87 
 
 
210 aa  128  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.03 
 
 
223 aa  128  2e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.19 
 
 
218 aa  128  2e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.21 
 
 
221 aa  128  2e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.94 
 
 
208 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.45 
 
 
217 aa  127  4e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.7 
 
 
227 aa  127  4e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.45 
 
 
218 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  4.7745e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  37.19 
 
 
213 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.69 
 
 
218 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
202 aa  127  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
219 aa  126  8e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
206 aa  126  8e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
219 aa  126  8e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.2 
 
 
197 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.17 
 
 
211 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.86 
 
 
208 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.19 
 
 
220 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.54 
 
 
215 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.46383e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.61 
 
 
236 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 
228 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.07 
 
 
207 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.33 
 
 
210 aa  123  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  7.28866e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.96 
 
 
237 aa  122  1e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.77 
 
 
214 aa  122  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.7 
 
 
207 aa  121  2e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.25 
 
 
207 aa  121  4e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.69 
 
 
211 aa  120  5e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.25 
 
 
226 aa  120  5e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.78 
 
 
212 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  42.86 
 
 
206 aa  120  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.15 
 
 
205 aa  119  1e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
223 aa  119  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
220 aa  119  1e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.36 
 
 
479 aa  119  1e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.86 
 
 
221 aa  119  2e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.78 
 
 
219 aa  118  2e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.15 
 
 
222 aa  119  2e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34 
 
 
219 aa  118  2e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.97058e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  36.61 
 
 
217 aa  118  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.63 
 
 
224 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.57 
 
 
205 aa  118  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.47 
 
 
211 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 
484 aa  117  4e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.15 
 
 
219 aa  117  7e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  37.81 
 
 
484 aa  117  7e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.08 
 
 
226 aa  116  8e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
206 aa  116  9e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.32 
 
 
218 aa  116  1e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
216 aa  116  1e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.65 
 
 
207 aa  115  2e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.65 
 
 
207 aa  115  2e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.16 
 
 
215 aa  115  2e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  36.31 
 
 
492 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>