45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0527 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1085 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  30.57 
 
 		 766 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  30.05 
 
 		 755 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  29.53 
 
 		 760 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.57 
 
 		 772 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30.05 
 
 		 760 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.05 
 
 		 779 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.05 
 
 		 765 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  31.93 
 
 		 766 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.05 
 
 		 542 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  32.42 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  35.4 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.57 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.7 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  31.44 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  27.85 
 
 		 399 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  25.9 
 
 		 995 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  30.21 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.06 
 
 		 1088 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  31.65 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.06 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.06 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  29.66 
 
 		 1070 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  29.66 
 
 		 1070 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.66 
 
 		 1112 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  29.03 
 
 		 858 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  32.94 
 
 		 1012 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  29.66 
 
 		 772 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  32.35 
 
 		 954 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  32.14 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  31.72 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  29.83 
 
 		 643 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  28.11 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.05 
 
 		 531 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  29.68 
 
 		 789 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  32.62 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  30.18 
 
 		 993 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  29.68 
 
 		 789 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  29.48 
 
 		 1011 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  24.76 
 
 		 994 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  29.32 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.75 
 
 		 877 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1052 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  39.39 
 
 		 587 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>