More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0526 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  39.9 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  38.94 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  38.94 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  38.94 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  38.94 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  42.79 
 
 		 263 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  43.19 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  43.2 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  39.61 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  39.91 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  41.78 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  39.53 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  43.37 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  38.16 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  37.68 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  33.94 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  29.65 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  29.91 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  35.78 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  42.56 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  34.06 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  33.62 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  32.7 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  36.87 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  37.08 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  32.84 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  37.99 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  36.28 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  32.73 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  36.28 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  35.78 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  36.31 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  34.05 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  37.77 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  36.31 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  36.32 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  34.64 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  33.17 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  31.6 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.5 
 
 		 708 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  35.71 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34.07 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  34.07 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34.07 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  35.75 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  34.07 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  34.88 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  35.2 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.24 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  35.75 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  35.75 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  34.07 
 
 		 225 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  30.81 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  35.75 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  31.13 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  32.3 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  35.02 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  31.34 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  32.29 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  32.21 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  32.8 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  34.83 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  36.31 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  33.49 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  33.15 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  39.66 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  30.23 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.67 
 
 		 646 aa  98.6  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  27.35 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  31.17 
 
 		 239 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  30.95 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  35.16 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  31.85 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  31.22 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  34.67 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  34.97 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  36.19 
 
 		 210 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  31.63 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  30.58 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>