More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0492 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  357  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  51.14 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.27 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  53.11 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  48.82 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  48.54 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  49.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  54.22 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  48.84 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 180 aa  177  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 178 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 180 aa  177  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  47.43 
 
 		 178 aa  177  9e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  48.3 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  50.28 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0490  50S ribosomal protein L6  48.8 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00133523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 179 aa  174  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  47.16 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>