More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0470 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  100 
 
 
264 aa  539  1e-152  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  51.95 
 
 
240 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  1.36112e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  55.05 
 
 
240 aa  245  5e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  52.59 
 
 
240 aa  244  8e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
235 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  52.47 
 
 
315 aa  234  1e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  47.16 
 
 
241 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
238 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  49.28 
 
 
217 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  45.34 
 
 
242 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  43.17 
 
 
231 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
232 aa  204  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 
232 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 
234 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 
234 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  44.2 
 
 
232 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  43.81 
 
 
232 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  43.81 
 
 
232 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 
234 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 
234 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 
232 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
230 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  45.54 
 
 
230 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 
259 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  41.52 
 
 
232 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  42.22 
 
 
232 aa  197  2e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  45.33 
 
 
246 aa  197  2e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  41.3 
 
 
252 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  43.5 
 
 
234 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  42.99 
 
 
232 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  42.92 
 
 
235 aa  191  8e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  4.06325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  46.12 
 
 
255 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.13 
 
 
238 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  45.78 
 
 
245 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  41.36 
 
 
233 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.47 
 
 
237 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.47 
 
 
237 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  44.44 
 
 
252 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  43.56 
 
 
249 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
242 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
236 aa  185  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.13 
 
 
225 aa  185  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.13 
 
 
225 aa  185  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  40.17 
 
 
242 aa  184  9e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.06 
 
 
230 aa  184  1e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.5 
 
 
233 aa  184  1e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.05959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.02 
 
 
231 aa  184  1e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  42.58 
 
 
232 aa  183  2e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  43.66 
 
 
228 aa  184  2e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.02 
 
 
239 aa  183  2e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.05 
 
 
233 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.05 
 
 
233 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
277 aa  182  4e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.05 
 
 
233 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.05 
 
 
233 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.05 
 
 
233 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
262 aa  182  5e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  41.74 
 
 
225 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  40.45 
 
 
229 aa  181  8e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  44.95 
 
 
235 aa  181  8e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  43.5 
 
 
233 aa  181  9e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.5 
 
 
233 aa  181  9e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.57106e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
233 aa  181  9e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
233 aa  181  9e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
233 aa  181  9e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.67258e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  40.69 
 
 
254 aa  181  9e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
233 aa  181  9e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.67827e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  43.5 
 
 
233 aa  181  9e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
249 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
233 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  41.94 
 
 
244 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  47.47 
 
 
246 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3612  ABC transporter related  41.31 
 
 
231 aa  179  3e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.6 
 
 
233 aa  179  3e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.31 
 
 
231 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  40.35 
 
 
235 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.35458e-07  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
241 aa  179  5e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.05 
 
 
233 aa  179  5e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 
248 aa  178  6e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
242 aa  179  6e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.06167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.06 
 
 
235 aa  179  6e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
254 aa  178  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
243 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
239 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  42.34 
 
 
239 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.2 
 
 
253 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.05672e-05  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  38 
 
 
255 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  44.29 
 
 
227 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.71 
 
 
237 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  43.24 
 
 
445 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  39.82 
 
 
231 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.74 
 
 
240 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  38.05 
 
 
242 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  42.93 
 
 
248 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  41.44 
 
 
238 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.78 
 
 
251 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.2 
 
 
253 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  40 
 
 
243 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 
229 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  43.64 
 
 
330 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.516819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>