96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0469 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
386 aa  783    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  51.3 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  50.52 
 
 
380 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  45.45 
 
 
366 aa  328  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  41.34 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  36.71 
 
 
382 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  35.23 
 
 
378 aa  222  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  33.42 
 
 
384 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  35.11 
 
 
380 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  31.7 
 
 
378 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  32.9 
 
 
378 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  32.9 
 
 
378 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 
378 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  31.87 
 
 
398 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  32.22 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  34.46 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  34.46 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
378 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
378 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
378 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
378 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
378 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  31.56 
 
 
378 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  31.56 
 
 
378 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  34.1 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 
397 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.61 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  27.6 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 
376 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  28.79 
 
 
374 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 
407 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  24.03 
 
 
402 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  26.03 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  26.53 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.54 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  23.86 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  22.22 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  22.45 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  23.68 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  22.86 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  21.94 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.2 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  23.5 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  21.68 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  23.17 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  19.95 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  19.8 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  20.25 
 
 
397 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  23.04 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.38 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  21.75 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  20.98 
 
 
395 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  19.9 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  20.45 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  22.08 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  22.76 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  22.76 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  21.92 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  22.43 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  22.17 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  19.65 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.75 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  22.18 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  22.44 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  18.43 
 
 
390 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  18.7 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  20.78 
 
 
379 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  20.1 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  20.45 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  20.19 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  35.45 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  32.5 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  35.45 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  35.45 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  35.45 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  32.5 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  18.05 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 
349 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  21.71 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  20.84 
 
 
401 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  28.33 
 
 
380 aa  46.2  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  31.67 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  19.15 
 
 
393 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  20.45 
 
 
348 aa  43.5  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  32.08 
 
 
416 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  32.74 
 
 
397 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  23.4 
 
 
400 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>