More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0458 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  100 
 
 
151 aa  310  4.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
154 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  43.61 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  43.38 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  44.85 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  44.2 
 
 
145 aa  116  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  43.38 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  37.86 
 
 
146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  41.61 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  36.05 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  40.58 
 
 
145 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  40 
 
 
148 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  39.42 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  39.73 
 
 
148 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  37.14 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.43 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  39.26 
 
 
147 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  39.26 
 
 
147 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  36.17 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  36.17 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  36.17 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  39.26 
 
 
181 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  39.72 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  36.11 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 
146 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  40.88 
 
 
139 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  37.96 
 
 
145 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  38.69 
 
 
145 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  38.85 
 
 
143 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  37.59 
 
 
149 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  38.35 
 
 
148 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  38.73 
 
 
148 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
146 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.69 
 
 
146 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  35.46 
 
 
147 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  37.96 
 
 
144 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
150 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  41.96 
 
 
146 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  40 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  40 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  40 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  40 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  40 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  35.92 
 
 
148 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  40 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  40 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  40 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  36.91 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  37.5 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
144 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  36.17 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  40 
 
 
164 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  39.58 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  37.31 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  40 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  38.03 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  34.72 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  36.23 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  36.64 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  36.92 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  36.92 
 
 
162 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  36.11 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  36.17 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  37.59 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  36.09 
 
 
147 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  34.62 
 
 
146 aa  94  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  37.06 
 
 
157 aa  93.6  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  34.56 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  36.09 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  35.88 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  36.92 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  33.85 
 
 
156 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  39.69 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  34.33 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  33.58 
 
 
151 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  35.38 
 
 
153 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  30.88 
 
 
160 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  35.81 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  34.81 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  37.7 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  36.15 
 
 
153 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  36.15 
 
 
153 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
144 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  36.15 
 
 
153 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  36.5 
 
 
153 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  32.37 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  34.81 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  35.38 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  36.64 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  36.7 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  36.64 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  35.38 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>