188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0383 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 289 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  51.58 
 
 		 289 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  51.22 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  48.75 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  47.67 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  47.35 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  48.53 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  45.42 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  44.52 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  45.94 
 
 		 286 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  43.82 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  44.17 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  44.17 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  46.45 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  44.29 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  45.39 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  45.02 
 
 		 275 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  45.02 
 
 		 275 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  43.26 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  44.28 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  42.75 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  43.16 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  42.8 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  42.86 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  40.29 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  41.29 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  41.67 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  41.67 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  41.06 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  41.29 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  40.91 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  41.29 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  43.12 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  42.54 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  41.29 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  41.13 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  41.89 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  41.89 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  41.89 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  41.89 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  41 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  41.89 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  41.67 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  39.02 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  41.67 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  41.89 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  38.93 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  40.91 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  40.91 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  39.02 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  41.51 
 
 		 285 aa  198  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  41.51 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  41.51 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  41.29 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  39.1 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  41.22 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  38.68 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  40.3 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  40.84 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  38.64 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  40.08 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  37.32 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  39.02 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  40.23 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  36.49 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  38.26 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  38.64 
 
 		 280 aa  188  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  37.12 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  39.16 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  39.55 
 
 		 284 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  40.15 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  36.94 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  37.77 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  38.64 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  37.31 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  38.4 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  37.94 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  37.55 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  36.36 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  34.98 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  37.97 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  36.74 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  36.76 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  36.62 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  33.46 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  35.27 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  36.05 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  37.64 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  38.38 
 
 		 266 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  35.09 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  35.09 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  34.48 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  36.65 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  35.07 
 
 		 463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  35.31 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  34.98 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  34.85 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  35.27 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  35.59 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  35.61 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>