279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0288 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  100 
 
 		 843 aa  1733    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  39.32 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  37.11 
 
 		 486 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  36.91 
 
 		 486 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  37.21 
 
 		 490 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  33.13 
 
 		 493 aa  243  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.15 
 
 		 466 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.97 
 
 		 490 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  34.41 
 
 		 496 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  34.82 
 
 		 464 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.67 
 
 		 456 aa  224  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  31.56 
 
 		 446 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.04 
 
 		 455 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  34.21 
 
 		 468 aa  210  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.38 
 
 		 448 aa  205  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  32.21 
 
 		 459 aa  204  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  37.86 
 
 		 327 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  37.86 
 
 		 327 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.08 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.1 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.06 
 
 		 450 aa  190  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.69 
 
 		 473 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  26.42 
 
 		 453 aa  188  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  37.46 
 
 		 354 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 328 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  35.82 
 
 		 328 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  30.98 
 
 		 468 aa  185  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  29.91 
 
 		 462 aa  184  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  31.21 
 
 		 461 aa  183  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.95 
 
 		 451 aa  183  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  31.55 
 
 		 487 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.53 
 
 		 467 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 328 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.21 
 
 		 469 aa  180  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.4 
 
 		 467 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 341 aa  178  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.27 
 
 		 465 aa  174  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 314 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  29.22 
 
 		 495 aa  171  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  34.63 
 
 		 328 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  31.87 
 
 		 467 aa  171  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 333 aa  170  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  34.63 
 
 		 328 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  34.63 
 
 		 328 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 329 aa  168  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 358 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.96 
 
 		 447 aa  167  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  34.33 
 
 		 328 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  34.32 
 
 		 328 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.79 
 
 		 452 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.81 
 
 		 343 aa  163  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.71 
 
 		 494 aa  161  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  32.76 
 
 		 332 aa  160  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  32.18 
 
 		 355 aa  160  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 313 aa  159  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 330 aa  157  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.07 
 
 		 476 aa  157  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 383 aa  157  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  29.29 
 
 		 511 aa  156  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  34.21 
 
 		 324 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  33.04 
 
 		 329 aa  152  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 339 aa  151  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 351 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  31.84 
 
 		 344 aa  145  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  27.81 
 
 		 506 aa  144  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  26.5 
 
 		 477 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  26.5 
 
 		 477 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  28.66 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.33 
 
 		 449 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 360 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  31.2 
 
 		 320 aa  128  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 367 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 367 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 346 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  31.5 
 
 		 359 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 407 aa  115  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  27.75 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 368 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 338 aa  107  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  28.95 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 369 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 361 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  25.14 
 
 		 337 aa  95.9  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.18 
 
 		 389 aa  95.1  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  28.09 
 
 		 347 aa  91.3  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 347 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  24.72 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.91 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  28.79 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  28.77 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  32.31 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  33.53 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  32.93 
 
 		 313 aa  72  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 344 aa  70.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 344 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.22 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>